世間を騒がせる怪盜ながら、暗號を織り交ぜた予告狀とキザなセリフ、華麗な手口（ショー）で數々の名寶を盜み出し人気を博す“怪盜キッド”。そんな神出鬼沒の大怪盜が誕生したのは……。江古田高校2年生、黒羽快斗。ある日、自宅にある隠し部屋を見つけ、世界的マジシャンだった父?黒羽盜一が実は世間をにぎわせていた〈怪盜キッド〉で、謎の組織に殺害されたことを知る。真相を探るため、快斗は盜一が遺した衣裝を身に纏い2代目〈怪盜キッド〉となり、盜一が追っていた“伝説のビッグジュエル”と、“謎の組織”の正體に迫っていく…。巧妙な手口で數々の獲物を盜み出すキッドが新たに狙ったのは、伝説のアクアマリン“大海の奇跡（ブルー?ワンダー）”。キッド獲得に執念を燃やす園子の親戚?鈴木財閥相談役鈴木次郎吉は、ビッグジュエルを使いキッドに挑戦狀を送りつけたのだ！次郎吉の挑戦に乗ったキッドは次郎吉?警察の警備をものともせず、いつものように鮮やかに盜み出すはずだったが、トリックを解き明かそうとコナンの名推理がはじまった！「コナンvs.怪盜キッド」「集められた名探偵！工藤新一vs.怪盜キッド」など、月下の奇術師?怪盜キッド誕生と、最大にして永遠のライバル?コナン／新一との初対決を新規映像とともに贈るTVシリーズ特別編集版??！